COMENTARIOS BIBLIOGRÁFICOS
Discovering Genomics, Proteomics and Bioinformatics
A. Malcolm Campbell and Laurie J. Meyer (2nd ed). San Francisco: CSHL Press; 2007 (447 páginas, tapa blanda)
El mundo de la Biología ha experimentado una profunda
transformación en los últimos años. Como consecuencia de
la secuenciación del genoma humano y debido a la creación
de bases de datos llenas de información sobre ácidos nucleicos,
proteínas y sus propiedades, la Biología, después
de mucho tiempo, se ha transformado en una ciencia verdaderamente
cuantitativa, como la química y la física.
Son muchos los desafíos. Recién se ha comenzado a conocer
el potencial de la genómica y la proteómica para expandir
la comprensión de la Biología y así poder contribuir
a mejorar la salud humana. Para que esta verdadera revolución
produzca todos los beneficios que promete, los científicos
deberán contar con los conocimientos necesarios para
interpretar creativamente semejante cantidad de datos, de
manera de poder descubrir así las claves de los más grandes
misterios de la vida.
Este libro ha sido pensado para proporcionar a los estudiantes
un sólido marco conceptual que les permita explorar
las complejas genómica y proteómica, a través de sus
principios básicos, al mismo tiempo que pone énfasis en el
rol integral de la bioinformática en el análisis de las complejas
bases de datos generadas por estas disciplinas.
Esta nueva edición presenta a la Biología a través de un
enfoque interactivo, basado en problemas, enfatizando la
genómica comparativa y la genómica de procariotes. Este
texto, actualizado y ampliado, contiene muchos "Maths Minutes",
que son ejercicios para estudiantes que exigen el
uso de cálculos estadísticos y probabilísticos a los efectos
de agregar rigor cuantitativo a la interpretación de complejos
conjuntos de datos.
Este libro multidisciplinario refleja la dinámica, cada vez
más compleja, de la investigación biológica en el Siglo XXI,
donde va a ser indispensable la experiencia en informática,
física, matemáticas, investigación clínica, bioética y muchas
otras disciplinas. Tales interacciones serán necesarias a nivel
individual, colaborativo y también a nivel interdisciplinario
en la medida en que surjan nuevas disciplinas en las interfases
entre las fronteras tradicionales de la investigación.
Otro componente novedoso de este libro son las "Discovery
Questions", que alientan a los estudiantes a profundizar
en los aspectos éticos, legales y sociales puestos de manifiesto
ante los avances en genómica y proteómica.
El término "genómica" hace referencia a la disciplina
que estudia el contenido completo de ADN de un organismo;
tal como es presentada en este libro incluye la interacción
de moléculas intracelulares que incluyen ADN, proteínas,
lípidos e hidratos de carbono.
Con espíritu de descubrimiento, en este texto se exploran
las herramientas y preguntas que encierra la revolución
que está cambiando la manera de estudiar la Biología.
Este libro se basa en dos principios pedagógicos que ya
han sido aplicados exitosamente: enseñar en el contexto de
una pregunta interesante y sobre la base de la "necesidad
de saber": es la manera de llegar a la información nueva,
ayudando así a los estudiantes en su motivación, que de esta
manera permitirá retener mejor los conocimientos.
El libro está armado sobre la base de estudios de casos
tomados de publicaciones científicas. Para responder a la
gran cantidad de preguntas que surgen, se recurre a la
bioinformática en la exploración de los contenidos científicos
y los procesos. Los primeros incluyen áreas como: secuencias
(genomas enteros y sus variaciones), microarreglos,
proteómica y sistemas biológicos. Este texto está planteado
como un recurso interactivo para explorar tópicos de
genómica y proteómica. Los números proporcionan datos
reales a partir de los cuales puede extraerse más información
que la inicialmente aparente. Las bases de datos online permiten realizar descubrimientos de la misma forma
que lo hacen los investigadores en el tema.
Las "Discovery Questions" permiten focalizar la atención
en información crítica, donde se potencializa la deducción
personal en base a las herramientas y a la información
presentada en textos y en figuras.
Los libros tradicionales proporcionan hechos y detalles
que deben ser memorizados. La genómica requiere analizar,
plantear hipótesis, pensar y formular modelos y este texto
permite desarrollar al pensamiento crítico.
Este libro es de fácil lectura y comprensión. Los términos
nuevos se definen en un glosario. La sección Discovering
Questions se focaliza en conceptos clave, así como en
diseños experimentales, interpretación de datos y en la necesidad
de basar la opinión en dichos datos. Para responder
algunas de estas preguntas deberá recurrirse a las bases
de datos online, regularmente actualizadas, disponibles
en el sitio Web de la compañía (www.geneticsplace.com.)
El texto consta de tres unidades, cada una dividida en
varios capítulos. La primera se refiere a las secuencias genómicas
en modelos animales, a las formas de secuencias,
a la genómica comparativa en evolución y a su relación con
la Medicina y, finalmente, a las variaciones genómicas.
La segunda unidad se refiere a la expresión genómica,
abarcando desde la investigación básica y aplicada, con microarreglos
de ADN, hasta la proteómica (estructuras tridimensionales
de proteínas, interacción de redes, electroforesis
bidimensional, cuantificación de proteomas en cultivos
celulares).
Finalmente, la tercera unidad trata de la perspectiva genómica
total: desarrollo de nuevas medicaciones, circuitos
genómicos en genes simples, circuitos genómicos integrados,
biología de sistemas e integración de los subconjuntos
de genomas y proteomas en modelos predictivos.