Abstract

HERNANDEZ-LEON, R; MARTINEZ-TRUJILLO, M; VALENCIA-CANTERO, E  and  SANTOYO, G. Construcción y caracterización de una biblioteca de ADN metagenómico de la rizósfera de trigo (Triticum aestivum). Phyton (B. Aires) [online]. 2012, vol.81, n.1, pp.133-137. ISSN 1851-5657.

El suelo rizosférico de las plantas de trigo contiene una alta diversidad de microorganismos y por lo tanto, constituye una gran reserva para el descubrimiento de los genes con diversas aplicaciones de la biotecnología agrícola. En este trabajo, hemos construido una biblioteca metagenómica empleando como huésped heterólogo E. coli, clonando grandes fragmentos de ADN genómico en un cromosoma artificial bacteriano (BAC), proveniente de la rizósfera de plantas de trigo. El promedio de los segmentos de ADN clonado varió de 5 a 80 kb, con un tamaño promedio de 38 kb. Los extremos de varias clonas BAC, tomadas al azar fueron secuenciadas. Los resultados de homología de los BACs analizados mostraron principalmente funciones metabólicas y catalíticas (40%), incluyendo amidohidrolasas, hidrolasas, peptidasas, serina proteasas, endonucleasas y exonucleasas. Otra parte interesante de las clonas reveló secuencias genómicas con función hipotética (17%) o desconocida (9%). Las secuencias metagenómicas pertenecen en su mayoría a Firmicutes, Proteobacterias, Arqueas, Actinobacterias, hongos, virus, bacterias y taxones desconocidos sin clasificar. Se espera que la biblioteca metagenómica del suelo rizosférico de las plantas de trigo siga creciendo. Al mismo tiempo, se están llevando a cabo análisis funcionales en la búsqueda de genes de interés agro-biotecnológico.

Keywords : Metagenómica; Rizósfera; Trigo.

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