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BAG. Journal of basic and applied genetics

On-line version ISSN 1852-6233

Abstract

BELTRAN-TORRES, G.C  and  HERNANDEZ-FERNANDEZ, J. Nuevos marcadores mitocondriales mejoran la filogenia de la tortuga carey Eretmochelys imbricata (Testudines: Cheloniidae). BAG, J. basic appl. genet. [online]. 2018, vol.29, n.2, pp.21-31. ISSN 1852-6233.

Las tortugas marinas (Cheloniidae) son un grupo de siete especies originadas en el cretaceo. Analisis de secuencias parciales de DNA mitocondrial han revelado inconsistencias filogeneticas dentro de este grupo de quelonios. Sin embargo, estos marcadores mitocondriales han permitido entender y dilucidar la composicion de las poblaciones en areas de forrajeo, habitos reproductivos, inferencias de patrones de migracion y tambien definir las unidades de manejo en el mundo, con el fin de proponer planes de manejo y conservacion. El objetivo de este estudio fue evaluar la posicion de la tortuga carey E. imbricata dentro de la familia Cheloniidae y la filogenia de las tortugas marinas utilizando genes mitocondriales codificantes de proteinas, genes ribosomicos y el genoma mitocondrial completo de la tortuga carey anidante del Caribe colombiano, al compararlo con las otras seis especies de tortugas marinas disponibles en GenBank. Se utilizaron cuatro metodos de inferencias filogeneticas: Neighbor-Joining (NJ), Maxima Verosimilitud (ML), Maxima Parsimonia (MP) e Inferencia Bayesiana (IB). Los arboles NJ, ML, MP e IB mostraron que ND2, COX1, 16S ARNr, ND5, 12S ARNr, ND4, COX3 y ND1 son los marcadores que presentan una mejor resolucion filogenetica con sustentos bootstrap entre 89,0% y 99,98%. Los genes ATP6, ATP8, COX2, ND3, ND4L y ND5 presentaron politomias y establecieron relaciones filogeneticas equivocadas. El analisis con el mitogenoma completo presento arboles altamente sustentados (bootstrap de 98,0%) en comparacion con el analisis con marcadores individuales. Los arboles obtenidos con el gen ND2 e IB resolvieron con buen sustento las relaciones evolutivas entre las especies comparadas, consolidandose la posicion de E. imbricata dentro de la tribu Carettini con probabilidad posterior de 0,98-1,0. Los marcadores ND2, ND5, ND4, COX3 y ND1 no han sido utilizados en trabajos previos y representan una nueva alternativa para explicar la filogenia en este grupo de reptiles marinos. En el presente caso utilizando mitogenomas completos se obtuvieron arboles robustos y altamente sustentados.

Keywords : Relaciones filogeneticas; Eretmochelys imbricata; Mitogenoma; Tortugas marinas; Bootstrap; Politomias.

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